Protein–RNA interactions for Protein: O88531

Ppt1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt1O88531 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt1O88531 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms