Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsd1O88491 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsd1O88491 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms