Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnnt1O88346 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms