Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nid2O88322 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nid2O88322 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nid2O88322 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms