Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms