Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp9aO70228 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp9aO70228 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp9aO70228 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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