Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms