Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg2O55111 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms