Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb6O54946 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms