Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarce1O54941 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms