Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16O54909 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms