Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200O54901 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200O54901 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms