Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limk2O54785 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limk2O54785 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limk2O54785 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms