Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrk1O54709 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrk1O54709 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrk1O54709 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms