Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EdaO54693 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EdaO54693 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EdaO54693 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EdaO54693 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EdaO54693 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EdaO54693 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EdaO54693 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EdaO54693 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EdaO54693 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EdaO54693 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EdaO54693 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EdaO54693 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EdaO54693 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EdaO54693 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EdaO54693 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms