Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab33bO35963 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms