Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm1O35954 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms