Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops5O35864 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops5O35864 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops5O35864 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.5 ms