Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6aO35464 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6aO35464 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms