Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppt2O35448 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppt2O35448 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppt2O35448 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms