Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms