Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Slc18a3O35304 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Slc18a3O35304 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc18a3O35304 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Slc18a3O35304 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Slc18a3O35304 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc18a3O35304 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Slc18a3O35304 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.6 ms