Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArxO35085 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ArxO35085 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ArxO35085 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ArxO35085 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArxO35085 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArxO35085 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArxO35085 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArxO35085 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArxO35085 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArxO35085 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArxO35085 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArxO35085 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArxO35085 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArxO35085 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArxO35085 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArxO35085 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms