Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3cO35066 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3cO35066 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms