Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap23O09044 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap23O09044 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms