Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms