Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl4M0QW46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms