Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3115L7N285 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3115L7N285 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3115L7N285 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3115L7N285 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms