Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20878L7N244 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms