Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2056J3QQ02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2056J3QQ02 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms