Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms