Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm19965J3QNY8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm19965J3QNY8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm19965J3QNY8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm19965J3QNY8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm19965J3QNY8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm19965J3QNY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gm19965J3QNY8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm19965J3QNY8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms