Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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