Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc180J3QNE4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc180J3QNE4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms