Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20825J3QM67 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20825J3QM67 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20825J3QM67 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20825J3QM67 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms