Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21818J3KMS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms