Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29394H3BIW7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms