Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r12G5E8G1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms