Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arfgef1G3X9K3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef1G3X9K3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms