Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna9G3X8Z7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chrna9G3X8Z7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna9G3X8Z7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna9G3X8Z7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms