Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim55G3X8Y1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms