Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700067P10RikG3X8U2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700067P10RikG3X8U2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700067P10RikG3X8U2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700067P10RikG3X8U2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700067P10RikG3X8U2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700067P10RikG3X8U2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms