Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20517G3UVU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20517G3UVU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20517G3UVU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms