Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms