Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arid4aF8VPQ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid4aF8VPQ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid4aF8VPQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms