Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M1F7CXU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms