Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms