Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2564F6Z9S8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2564F6Z9S8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2564F6Z9S8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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