Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms