Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17093F6XGJ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms